Pesquisa de mestrado da UFSC é premiada em Congresso de Bioinformática e indicada para evento internacional na França
Bruna Russi, durante premiação. Foto: Arquivo Pessoal.
A dissertação de mestrado de Bruna Caroline Russi, atualmente doutoranda do Programa de Pós-graduação em Biotecnologia e Biociências da Universidade Federal de Santa Catarina (PPGBTC/UFSC), foi premiada no Congresso Brasileiro de Bioinformática (X-Meeting), organizado pela Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional (AB3C), que ocorreu entre os dias 9 e 12 de Junho de 2026.
A pesquisa de Bruna, que foi desenvolvida no Laboratório de Bioinformática – vinculado ao departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia (MIP/CCB/UFSC) e ao PPGBTC – sob a orientação do professor Renato Simões Moreira, recebeu o prêmio Jovem Bioinformata 2026. Seu trabalho poderá contribuir para o desenvolvimento de novos tratamentos de doenças que afetam o sistema imunológico.
“Minha dissertação de mestrado consistiu no desenvolvimento do EpiBuilder 2.0, uma plataforma web gratuita e de código aberto voltada para a predição e análise computacional (in silico) de epítopos lineares de células B (alvos imunológicos). Na área de proteômica e imunologia, a identificação de epítopos é fundamental no contexto de saúde de precisão para apoiar o estudo de doenças que afetam o sistema imunológico, possibilitando a prototipagem de novas terapias e vacinas personalizadas”, explica Bruna.
Segundo a pesquisadora, a aplicação do EpiBuilder tem foco no estudo de patógenos, que é o foco do Laboratório de Bioinformática, com o diferencial de utilizarem uma IA capaz de prever alvos úteis em contexto de oncologia e neurologia. O estudo faz parte de uma linha de pesquisa que havia sido iniciada pelo professor Renato Simões Moreira: “A primeira versão do EpiBuilder foi um dos produtos da tese do meu orientador, que me orientou nesta segunda versão.”
Nesta atualização, conforme explica, a arquitetura do software foi repensada para um funcionamento modular, automatizado e escalável, integrando tecnologias consolidadas na indústria (como Docker, NextFlow e banco de dados) com computação paralela, algoritmos específicos de biologia computacional e modelos de aprendizado de máquina.
“O grande diferencial do EpiBuilder 2.0 é esta arquitetura, mas também o foco na usabilidade de pesquisadores da área biotecnológica e na conformidade com os padrões internacionais de qualidade de software ISO/IEC 25010:2023 e ISO 25019:2023. Isso garante padronização, reprodutibilidade e um fluxo de trabalho automatizado que facilita e acelera o estudo proteômico”, afirma Bruna.
Em razão do prêmio, Bruna foi indicada para um flash talk nas Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), principal evento de Bioinformática da França, que ocorre de 16 e 19 de junho. O flash talk é uma apresentação oral on-line, curta e dinâmica (de poucos minutos), cujo objetivo é expor os pontos mais inovadores da pesquisa para a comunidade científica europeia. “Esta oportunidade poderá abrir portas para futuras colaborações entre Brasil e França”, comemora Bruna.
O EpiBuilder está disponível aqui.
A dissertação de mestrado da Bruna está disponível na íntegra aqui.
